| กรมและหน่วยงานในสังกัด |
 กลุ่มภารกิจด้านทรัพยากรน้ำในแผ่นดิน |
| สำนักงานรัฐมนตรี |
| สำนักงานปลัดกระทรวง |
 สำนักตรวจและประเมินผล |
| สำนักนโยบายและยุทธศาสตร์ |
| สำนักการบินอนุรักษ์ทรัพยากรธรรมชาติ |
| ศูนย์เทคโนโลยีสารสนเทศและการสื่อสาร |
| กรมควบคุมมลพิษ |
| กรมทรัพยากรทางทะเลและชายฝั่ง |
| กรมทรัพยากรธรณี |
| กรมทรัพยากรน้ำ |
| กรมทรัพยากรน้ำบาดาล |
| ศูนย์ทรัพยากรน้ำบาดาลภาค 1 จ.นครราชสีมา |
| ศูนย์ทรัพยากรน้ำบาดาลภาค 2 จ.สระบุรี |
| ศูนย์ทรัพยากรน้ำบาดาลภาค 3 จ.ขอนแก่น |
| ศูนย์ทรัพยากรน้ำบาดาลภาค 4 จ.สุพรรณบุรี |
| ศูนย์ทรัพยากรน้ำบาดาลภาค 5 จ.ตรัง |
| ศูนย์ทรัพยากรน้ำบาดาลภาค 6 จ.ลำปาง |
| ศูนย์ทรัพยากรน้ำบาดาลภาค 7 จ.อุบลราชธานี |
| ศูนย์ทรัพยากรน้ำบาดาลภาค 8 จ.ชลบุรี |
| ศูนย์ทรัพยากรน้ำบาดาลภาค 9 จ.อุดรธานี |
| ศูนย์ทรัพยากรน้ำบาดาลภาค 10 จ.ราชบุรี |
| ศูนย์ทรัพยากรน้ำบาดาลภาค 11 จ.สงขลา |
| ศูนย์ทรัพยากรน้ำบาดาลภาค 12 จ.กำแพงเพชร |
| สำนักพัฒนาน้ำบาดาล |
| กองวิเคราะห์น้ำบาดาล |
| กรมป่าไม้ |
| กรมส่งเสริมคุณภาพสิ่งแวดล้อม |
| กรมอุทยานแห่งชาติ สัตว์ป่าและพันธุ์พืช |
| สำนักนโยบายและแผนทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม |
| องค์การจัดการน้ำเสีย |
| องค์การสวนพฤษศาสตร์ |
| องค์การสวนสัตว์ในพระบรมราชูปถัมภ์ |
| องค์การอุตสาหกรรมป่าไม้ |
| บริษัทไม้อัดไทยจำกัด |
| สวนสัตว์กลางคืนจังหวัดเชียงใหม่ |
| ศูนย์ปฏิบัติการป้องกันและปราบปรามการบุกรุกทำลายทรัพยากรป่าไม้ |
| ศูนย์บริการประชาชน (ศูนย์บริการร่วม) |